Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cep41Q99NF3 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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