Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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NsmfQ99NF2 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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NsmfQ99NF2 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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NsmfQ99NF2 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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