Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

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Length 921 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp11Q99K46 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp11Q99K46 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp11Q99K46 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Usp11Q99K46 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp11Q99K46 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Usp11Q99K46 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Usp11Q99K46 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp11Q99K46 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Usp11Q99K46 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Usp11Q99K46 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp11Q99K46 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp11Q99K46 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Usp11Q99K46 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp11Q99K46 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Usp11Q99K46 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp11Q99K46 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Usp11Q99K46 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp11Q99K46 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp11Q99K46 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp11Q99K46 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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