Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Ctu1Q99J10 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Ctu1Q99J10 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms