Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Cldn16Q925N4 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn16Q925N4 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms