Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Dnajc28Q8VCE1 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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