Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Abcf3Q8K268 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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