Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZX4

Rbm17, Splicing factor 45, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm17Q8JZX4 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbm17Q8JZX4 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbm17Q8JZX4 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbm17Q8JZX4 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbm17Q8JZX4 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbm17Q8JZX4 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbm17Q8JZX4 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbm17Q8JZX4 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbm17Q8JZX4 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbm17Q8JZX4 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbm17Q8JZX4 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbm17Q8JZX4 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbm17Q8JZX4 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbm17Q8JZX4 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbm17Q8JZX4 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbm17Q8JZX4 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbm17Q8JZX4 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbm17Q8JZX4 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbm17Q8JZX4 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbm17Q8JZX4 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbm17Q8JZX4 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbm17Q8JZX4 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbm17Q8JZX4 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbm17Q8JZX4 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbm17Q8JZX4 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbm17Q8JZX4 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbm17Q8JZX4 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbm17Q8JZX4 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbm17Q8JZX4 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbm17Q8JZX4 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbm17Q8JZX4 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbm17Q8JZX4 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbm17Q8JZX4 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbm17Q8JZX4 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbm17Q8JZX4 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbm17Q8JZX4 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbm17Q8JZX4 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbm17Q8JZX4 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbm17Q8JZX4 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbm17Q8JZX4 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbm17Q8JZX4 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbm17Q8JZX4 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbm17Q8JZX4 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rbm17Q8JZX4 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rbm17Q8JZX4 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbm17Q8JZX4 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbm17Q8JZX4 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbm17Q8JZX4 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbm17Q8JZX4 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbm17Q8JZX4 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbm17Q8JZX4 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbm17Q8JZX4 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbm17Q8JZX4 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rbm17Q8JZX4 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbm17Q8JZX4 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbm17Q8JZX4 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbm17Q8JZX4 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbm17Q8JZX4 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbm17Q8JZX4 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbm17Q8JZX4 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rbm17Q8JZX4 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbm17Q8JZX4 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rbm17Q8JZX4 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rbm17Q8JZX4 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbm17Q8JZX4 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbm17Q8JZX4 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbm17Q8JZX4 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbm17Q8JZX4 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbm17Q8JZX4 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbm17Q8JZX4 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbm17Q8JZX4 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbm17Q8JZX4 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbm17Q8JZX4 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbm17Q8JZX4 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbm17Q8JZX4 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rbm17Q8JZX4 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rbm17Q8JZX4 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbm17Q8JZX4 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbm17Q8JZX4 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbm17Q8JZX4 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbm17Q8JZX4 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbm17Q8JZX4 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbm17Q8JZX4 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbm17Q8JZX4 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbm17Q8JZX4 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rbm17Q8JZX4 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rbm17Q8JZX4 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbm17Q8JZX4 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rbm17Q8JZX4 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rbm17Q8JZX4 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rbm17Q8JZX4 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rbm17Q8JZX4 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbm17Q8JZX4 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rbm17Q8JZX4 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rbm17Q8JZX4 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rbm17Q8JZX4 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbm17Q8JZX4 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rbm17Q8JZX4 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rbm17Q8JZX4 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rbm17Q8JZX4 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms