Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms