Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

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Length 628 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Nek11Q8C0Q4 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Nek11Q8C0Q4 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek11Q8C0Q4 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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