Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

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Length 654 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms