Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI0

Fbxo38, F-box only protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo38Q8BMI0 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo38Q8BMI0 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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