Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHH8

Clrn3, Clarin-3, mousemouse

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Length 226 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3Q8BHH8 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clrn3Q8BHH8 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clrn3Q8BHH8 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clrn3Q8BHH8 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clrn3Q8BHH8 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clrn3Q8BHH8 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clrn3Q8BHH8 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clrn3Q8BHH8 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clrn3Q8BHH8 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clrn3Q8BHH8 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Clrn3Q8BHH8 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Clrn3Q8BHH8 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Clrn3Q8BHH8 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Clrn3Q8BHH8 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Clrn3Q8BHH8 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clrn3Q8BHH8 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clrn3Q8BHH8 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clrn3Q8BHH8 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clrn3Q8BHH8 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clrn3Q8BHH8 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clrn3Q8BHH8 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clrn3Q8BHH8 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clrn3Q8BHH8 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clrn3Q8BHH8 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Clrn3Q8BHH8 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Clrn3Q8BHH8 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clrn3Q8BHH8 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clrn3Q8BHH8 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clrn3Q8BHH8 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Clrn3Q8BHH8 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clrn3Q8BHH8 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Clrn3Q8BHH8 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clrn3Q8BHH8 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Clrn3Q8BHH8 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clrn3Q8BHH8 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Clrn3Q8BHH8 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Clrn3Q8BHH8 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Clrn3Q8BHH8 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clrn3Q8BHH8 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Clrn3Q8BHH8 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clrn3Q8BHH8 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Clrn3Q8BHH8 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clrn3Q8BHH8 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Clrn3Q8BHH8 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clrn3Q8BHH8 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clrn3Q8BHH8 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clrn3Q8BHH8 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Clrn3Q8BHH8 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Clrn3Q8BHH8 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clrn3Q8BHH8 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clrn3Q8BHH8 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clrn3Q8BHH8 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clrn3Q8BHH8 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clrn3Q8BHH8 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clrn3Q8BHH8 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clrn3Q8BHH8 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clrn3Q8BHH8 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clrn3Q8BHH8 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms