Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms