Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.5 ms