Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZI6

Lrsam1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrsam1Q80ZI6 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrsam1Q80ZI6 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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