Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NanogQ80Z64 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NanogQ80Z64 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
NanogQ80Z64 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NanogQ80Z64 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NanogQ80Z64 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NanogQ80Z64 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NanogQ80Z64 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
NanogQ80Z64 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NanogQ80Z64 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NanogQ80Z64 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NanogQ80Z64 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NanogQ80Z64 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NanogQ80Z64 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NanogQ80Z64 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NanogQ80Z64 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NanogQ80Z64 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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