Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube2q1Q7TSS2 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms