Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms