Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smchd1Q6P5D8 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms