Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms