Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC8.46□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms