Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms