Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Gm15171-201ENSMUST00000122191 334 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Gm9520-201ENSMUST00000209460 1253 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc34Q3UI66 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms