Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX8

Rufy4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy4Q3TYX8 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rufy4Q3TYX8 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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