Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 2810006K23Rik-201ENSMUST00000077376 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26848-201ENSMUST00000181052 2467 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c3Q3TMP1 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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