Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGF2

Fam107b, Protein FAM107B, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107bQ3TGF2 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam107bQ3TGF2 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms