Protein–RNA interactions for Protein: Q3L180

Defa26, Alpha-defensin 26, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa26Q3L180 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa26Q3L180 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa26Q3L180 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa26Q3L180 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa26Q3L180 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa26Q3L180 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa26Q3L180 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa26Q3L180 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa26Q3L180 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa26Q3L180 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa26Q3L180 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa26Q3L180 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa26Q3L180 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa26Q3L180 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa26Q3L180 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa26Q3L180 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Defa26Q3L180 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa26Q3L180 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa26Q3L180 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa26Q3L180 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa26Q3L180 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa26Q3L180 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa26Q3L180 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Defa26Q3L180 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa26Q3L180 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa26Q3L180 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa26Q3L180 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa26Q3L180 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa26Q3L180 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Defa26Q3L180 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa26Q3L180 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa26Q3L180 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa26Q3L180 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Defa26Q3L180 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa26Q3L180 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa26Q3L180 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Defa26Q3L180 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Defa26Q3L180 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa26Q3L180 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa26Q3L180 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa26Q3L180 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa26Q3L180 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa26Q3L180 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa26Q3L180 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Defa26Q3L180 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Defa26Q3L180 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Defa26Q3L180 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa26Q3L180 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa26Q3L180 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa26Q3L180 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa26Q3L180 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa26Q3L180 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa26Q3L180 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa26Q3L180 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa26Q3L180 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa26Q3L180 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa26Q3L180 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa26Q3L180 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa26Q3L180 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa26Q3L180 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa26Q3L180 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa26Q3L180 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa26Q3L180 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa26Q3L180 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa26Q3L180 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa26Q3L180 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa26Q3L180 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa26Q3L180 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa26Q3L180 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa26Q3L180 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa26Q3L180 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa26Q3L180 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa26Q3L180 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa26Q3L180 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa26Q3L180 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa26Q3L180 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms