Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms