Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms