Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pate4Q09098 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms