Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
F13bQ07968 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
F13bQ07968 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
F13bQ07968 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
F13bQ07968 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
F13bQ07968 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
F13bQ07968 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
F13bQ07968 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
F13bQ07968 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
F13bQ07968 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
F13bQ07968 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
F13bQ07968 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms