Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top1Q04750 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top1Q04750 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top1Q04750 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top1Q04750 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top1Q04750 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top1Q04750 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top1Q04750 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Top1Q04750 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Top1Q04750 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Top1Q04750 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Top1Q04750 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Top1Q04750 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms