Protein–RNA interactions for Protein: P97801

Smn1, Survival motor neuron protein, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smn1P97801 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Smn1P97801 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smn1P97801 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smn1P97801 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smn1P97801 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Smn1P97801 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smn1P97801 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smn1P97801 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smn1P97801 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smn1P97801 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smn1P97801 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smn1P97801 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smn1P97801 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smn1P97801 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms