Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cited1P97769 1700001J11Rik-202ENSMUST00000190330 2463 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Anks1b-203ENSMUST00000099368 2799 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Syncrip-207ENSMUST00000174269 3286 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Cited1P97769 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Cited1P97769 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Mid1-204ENSMUST00000112104 3860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Cited1P97769 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Cited1P97769 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Cited1P97769 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Rnh1-201ENSMUST00000106033 2091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Gm43221-201ENSMUST00000197612 2071 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Gm16387-201ENSMUST00000180990 2632 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Prr30-201ENSMUST00000057718 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Zfp512-201ENSMUST00000076264 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Cited1P97769 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Sp3-201ENSMUST00000066003 3808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Gm45289-201ENSMUST00000211048 2577 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Cited1P97769 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Gm45769-201ENSMUST00000204588 1828 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Prkag2-201ENSMUST00000030784 3331 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.4 ms