Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrig1P70193 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms