Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga11P61622 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga11P61622 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga11P61622 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga11P61622 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga11P61622 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga11P61622 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga11P61622 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Itga11P61622 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itga11P61622 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms