Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms