Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Epb41P48193 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Epb41P48193 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Epb41P48193 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Epb41P48193 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Epb41P48193 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Epb41P48193 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Epb41P48193 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Epb41P48193 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Epb41P48193 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Epb41P48193 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Epb41P48193 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb41P48193 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb41P48193 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Epb41P48193 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Epb41P48193 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Epb41P48193 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb41P48193 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb41P48193 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Epb41P48193 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb41P48193 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Epb41P48193 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Epb41P48193 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Epb41P48193 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Epb41P48193 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Epb41P48193 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Epb41P48193 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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