Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpl28P41105 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
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