Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ThpoP40226 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ThpoP40226 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ThpoP40226 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ThpoP40226 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ThpoP40226 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ThpoP40226 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ThpoP40226 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ThpoP40226 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ThpoP40226 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ThpoP40226 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.8 ms