Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RxraP28700 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RxraP28700 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RxraP28700 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RxraP28700 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RxraP28700 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
RxraP28700 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RxraP28700 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
RxraP28700 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
RxraP28700 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
RxraP28700 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
RxraP28700 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RxraP28700 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RxraP28700 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RxraP28700 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RxraP28700 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
RxraP28700 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RxraP28700 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
RxraP28700 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RxraP28700 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RxraP28700 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RxraP28700 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RxraP28700 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RxraP28700 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RxraP28700 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RxraP28700 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RxraP28700 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RxraP28700 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RxraP28700 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RxraP28700 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RxraP28700 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RxraP28700 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RxraP28700 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RxraP28700 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RxraP28700 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RxraP28700 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RxraP28700 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RxraP28700 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RxraP28700 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RxraP28700 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RxraP28700 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RxraP28700 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RxraP28700 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RxraP28700 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RxraP28700 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RxraP28700 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RxraP28700 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RxraP28700 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RxraP28700 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RxraP28700 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RxraP28700 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RxraP28700 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RxraP28700 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RxraP28700 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RxraP28700 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RxraP28700 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RxraP28700 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RxraP28700 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RxraP28700 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RxraP28700 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RxraP28700 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RxraP28700 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
RxraP28700 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RxraP28700 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RxraP28700 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RxraP28700 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RxraP28700 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RxraP28700 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RxraP28700 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RxraP28700 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RxraP28700 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RxraP28700 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RxraP28700 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RxraP28700 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RxraP28700 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RxraP28700 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RxraP28700 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RxraP28700 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RxraP28700 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
RxraP28700 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RxraP28700 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RxraP28700 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RxraP28700 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RxraP28700 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RxraP28700 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RxraP28700 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RxraP28700 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
RxraP28700 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RxraP28700 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RxraP28700 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RxraP28700 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RxraP28700 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RxraP28700 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RxraP28700 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RxraP28700 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RxraP28700 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
RxraP28700 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
RxraP28700 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RxraP28700 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
RxraP28700 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
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