Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms