Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkchP23298 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkchP23298 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkchP23298 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkchP23298 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkchP23298 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkchP23298 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrkchP23298 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrkchP23298 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkchP23298 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkchP23298 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkchP23298 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms