Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou3f1P21952 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms