Protein–RNA interactions for Protein: P21619

Lmnb2, Lamin-B2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb2P21619 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lmnb2P21619 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.7 ms