Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Fcer1aP20489 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Fcer1aP20489 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms