Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms