Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifnb1P01575 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms