Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clk2O35491 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clk2O35491 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Clk2O35491 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clk2O35491 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Clk2O35491 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Clk2O35491 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clk2O35491 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clk2O35491 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Clk2O35491 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Clk2O35491 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Clk2O35491 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
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Clk2O35491 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Clk2O35491 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Clk2O35491 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Clk2O35491 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Clk2O35491 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Clk2O35491 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Clk2O35491 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Clk2O35491 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clk2O35491 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Clk2O35491 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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